Завод «Медсинтез» был основан в 2003 году, и сегодня он входит в Некоммерческое Партнерство «Уральский биомедицинский кластер», который объединяет более 20 компаний-участников.

В марте 2004 года завод получил лицензию на производство лекарственных средств.

В 2005-ом здесь внедрена система менеджмента качества по версии МС ISO 9001:2000. Организация производства и контроля качества лекарственных средств сертифицирована на соответствие европейским требованиям GMP.

В 2007 году заводу «Медсинтез» присуждена премия Правительства Российской Федерации в области качества за достижение значительных результатов в области качества продукции и услуг, а также за внедрение высокоэффективных методов менеджмента.

В январе 2008 г. заводом «Медсинтез» была получена лицензия на производство готовых лекарственных форм генно-инженерного инсулина человека. В том же году при участии губернатора Свердловской области Э.Э. Росселя состоялось открытие первого в России цеха по производству готовых форм генно-инженерного инсулина человека, сертифицированного в соответствии с требованиями GMP EC. Контроль качества сырья и продукции осуществляется в аналитической и микробиологической лабораториях, аккредитованных в Росздравнадзоре РФ.

В 2009 году ООО «Завод Медсинтез» признано Дипломантом премии Содружества Независимых Государств за достижения в области качества продукции и услуг.

В ноябре 2012 года международный химико-фармацевтический концерн Bayer и завод «Медсинтез» подписали соглашение о стратегическом партнерстве. Цель сотрудничества – производство препаратов для лечения инфекционных заболеваний. Первым совместно произведенным лекарством стал антибиотик Avelox (Авелокс) – антибактериальный препарат нового поколения широкого спектра действия.

В июле 2013 года завод успешно прошел сертификационный аудит Bayer AG перед выпуском первых валидационных серий антибиотика Avelox (Авелокс). Проверку на соответствие требованиям GMP, директивам и стандартам Bayer AG прошел цех по производству инфузионных растворов. Были произведены тестовые серии и проведен трансфер аналитических и микробиологических методик между лабораториями ООО "Завод Медсинтез" и лабораторией "Bayer". Осенью 2013 года были выпущены три валидационные серии, которые заложены на стабильность.

В октябре 2013 года перед визитом государственных инспекторов Украины подготовительный аудит на соответствие требованиям GMP прошел цех по производству готовых лекарственных форм генно-инженерного инсулина человека.

В сентябре 2014 года завод «Медсинтез» получил регистрационное удостоверение на производство нового противовирусного препарата Триазавирин®.

Другим значимым событием для «Медсинтеза» в 2014 году стало начало реализации проекта «Импортозамещающее производство генно-инженерного и аналогового инсулина из собственной субстанции». Фонд развития промышленности РФ поддержал проект, выделив уральскому заводу займ в размере 183 млн. рублей. В рамках проекта были созданы: современная научно-исследовательская лаборатория генетики и биотехнологии, пилотный участок для разработки технологии получения субстанций инсулина.

«Медсинтез» начал активно развивать биотехнологическое направление по созданию собственной субстанции генно-инженерного инсулина и его аналогов.

В первом квартале 2015 года запущен цех твердых лекарственных форм мощностью до 30 тонн в год. Началось промышленное производство Триазавирина®.

В 2015 году значительно расширилась номенклатура цеха инфузионных растворов: запущено производство рентгенконтрастных препаратов под брендом BayerAG – Ultravist, Magnevist.

В сентябре 2017 года в рамках реализации крупного проекта "Импортозамещающее производство генно-инженерного и аналогового инсулина из собственной субстанции" завод зарегистрировал свою первую субстанцию инсулина – «Росинсулин». В конце января 2018 года было подано заявление о включении в государственный реестр лекарственных средств субстанции аналогового инсулина – "Росинсулин Аспарт". Началась первая фаза клинических испытаний самого сложного препарата "Росинсулин Гларгин".

Кроме этого, в 2017 году предприятие прошло полномасштабный аудит BureauVeritasCertification. Проверка подтвердила полное соответствие завода европейским стандартам качества версии ISO 9001:2015. Все производство отвечает требованиями GMP EC.

Высокий уровень действующих на заводе стандартов качества и технологий, а также возможности оборудования привлекают международных партнеров для производства в России своих медикаментов. 

Так в 2017 году «Медсинтез» выпустил первую тестовую серию современного антибиотика «Зеникс», входящего в продуктовый портфель компании STADA в России.  Сейчас выпущенный препарат тоже проходит тесты на стабильность. Еще один антибиотик появится в списке производимых лекарств ООО «Завод Медсинтез» после завершения испытаний и регистрационных мероприятий, к середине 2018 года.

Важным достижением 2017 года стало включение противовирусного средства Триазавирин® в Федеральные клинические рекомендации Минздрава РФ «Грипп у взрослых». Под редакцией главного инфекциониста Минздрава России Ирины Шестаковой.

Продолжается сотрудничество с немецким концерном Bayer. В 2017 году была выпущена тестовая серии Авелокса в твердой, таблетированной форме.

В 2018 году завод «Медсинтез» стал участником Ассоциации медицинских и фармацевтических производителей Свердловской области, созданной по предложению и при поддержке министра здравоохранения Свердловской области А. И. Цветкова и Министерства промышленности и науки Свердловской области.

В конце 2018 года в рамках реализации проекта по созданию собственной субстанции инсулина и аналогов была зарегистрирована субстанция аналогового инсулина – «Росинсулин Аспарт». Министерство здравоохранения России уже выдало решение о включении препарата в государственный реестр лекарственных средств для медицинского применения. В данный момент ожидается решение Минздрава РФ по добавлению в Госреестр лекарственных средств еще одного аналогового препарата – «Росинсулин Гларгин». Готовые лекарственные формы на основе собственных субстанций инсулина Аспарт «Медсинтез» планирует вывести на рынок к 2021 году, а инсулина Гларгин - к 2022 году.

В 2019 году по соглашению с компанией ООО «АйВиФарма» на заводе «Медсинтез» произведены первые четыре серии фармацевтической субстанции первого российского препарата для лечения бесплодия у человека Примапур® - рекомбинантного фолликулостимулирующего гормона, применяемого в процедуре экстракорпорального оплодотворения (ЭКО), а также выпущены первые четыре промышленных партии готовых лекарственных форм препарата для клиник. Препарат выпускается в виде удобной для использования одноразовой шприц-ручки. Максимальный объем производства препарата на заводе «Медсинтез» составит до 30 грамм субстанции в год (до 1 млн. одноразовых шприц-ручек), что составляет 200-250% существующего рынка РФ. 

Завод «Медсинтез» продолжает исследования по расширению клинических показаний применения препарата «Триазавирин». Так, в 2019 году проведена вторая фаза, а в июне 2020 года успешно завершена третья фаза клинических исследований препарата «Триазавирин» в отношении лечения острых респираторных вирусных инфекций, в результате которых установлена высокая эффективность лечения ОРВИ и подтверждена безопасность применения препарата.

В 2020 году ведущие российские ученые и клиницисты включили противовирусный препарат Триазавирин во временные методические рекомендации «Лекарственная терапия острых респираторных вирусных инфекций (ОРВИ) в амбулаторной практике в период эпидемии COVID-19».

Весной 2020 года на заводе «Медсинтез» оперативно запущены две технологичные автоматические линии по производству трехслойных защитных масок со слоем высокой фильтрации. Производительность одноразовых масок составляет 4-5 млн. шт. в месяц. В условиях борьбы с распространением коронавирусной инфекции собственное региональное производство защитных средств позволит удовлетворить спрос в больницах и аптеках Свердловской области.

15 мая 2020 года Ученым Советом Уральского государственного медицинского университета утверждены методические рекомендаций «О применении препарата Триазавирин для лечения и постэкспозиционной профилактики новой коронавирусной инфекции - COVID-19». 

19 июня 2020 года завод «Медсинтез» включен в список системообразующих предприятий России Правительственной комиссией по повышению устойчивости развития российской экономики.

Перспективы дальнейшего развития руководство завода связывает с выпуском новых видов медицинской продукции и освоением новых рынков сбыта. Фармацевтическое направление предполагается развивать путем реализации ряда проектов по организации производства лекарственных средств и активных фармацевтических субстанций.